《素问•脏气法时论》曰：“肾苦燥，急食辛以润之，开腠理，致津液通气也”。肾苦燥，当是指全身津液虚少，体表皮肤干燥少津，正是少阴病的病证。急食辛以润之，是指用辛药开膜理、致津液，实即指发汗。急者，是因正气虚衰，邪在表停留的时间很短暂，不抓紧治疗将很快传里，这正是说明了少阴病的治疗原则。体现这一治法的是第302条，即“少阴病，得之二三日，麻黄附子甘草汤微发汗，以二三日无里证，故微发汗也”，得之二三日，是说时间不长，邪尚可在表。强调无里证则更证实邪在表，也同时说明少阴主表不主里。用麻黄附子甘草汤微发汗，是治疗单纯少阴病的方法和方药。用麻黄或桂枝发汗解表，这一点与太阳病是相同的，不同的是，太阳病因气血津液俱盛，用麻黄、桂枝、杏仁等发汗解表即可，而少阴病因气血津液俱衰，治虽须发汗解表，但发汗不得太过，而且必须配加附子细辛等温性亢奋、强壮沉衰之药以助正气驱邪外出，这也即少阴病的治疗原则。
少阴病又常出现合病、并病，其治疗又有不同，但多数情况仍以微发汗为原则，如第316条“少阴病，下利，白通汤主之”，这是少阴太阴合病，即表里合病，治疗唯发其汗，则表里皆治。又如第301条“少阴病始得之，反发热，脉沉者，麻黄附子细辛汤主之”。《金匮要略•水气病》曰“脉得诸沉，当责有水”。可知这里的脉沉主水饮，即此条是说少阴病合并痰饮之证，或素有痰饮者出现表邪为水饮所郁而化热的少阴证时，治疗在微发汗的同时加入强壮亢奋、温化痰饮的细辛。再如第20条“太阳病，发汗，遂漏不止，其人恶风便难，四肢微急，难以屈伸者，桂枝加附子汤主之”。是因误治由表阳证(太阳病)陷入表阴证(少阴病)，用桂枝加附子汤强壮发汗解表。还有第22条“若(脉)微，恶寒者，桂枝去芍药加附子汤主之”，也是少阴病的治疗，仍属强壮发汗解表。这些方证，说明了少阴病的治疗原则。
与太阳病相同，少阴病常合并痰饮、瘀血等，治疗时当随证治之。