针灸治疗配穴至关重要，因为它是通过一定的穴位来完成的。在此，临床治疗中穴位的选取和配伍，要根据病情和患者自身的情况选用适当的疗法。或单用一法，或合用几法，以达到“杂合以各得其所宜”（《素问·异法方宜论》）的目的。如《素问·异法方宜论》又讲：“故治之所以异而病皆愈者，得病之情，知治之大体也。”现将李氏选穴原则、配穴方法和临床应用总结于下：
（一）配穴原则李氏对穴位的选取可归纳为近取、远取、随症取三种。近取是指选取病痛的局部和邻近的穴位；远取是指在病痛的远隔部选穴；随症取穴是指对某些全身证候的经验取穴。三者都是以经络学说为依据，临床时可单独使用，也可合之使用。
１．近部配穴法：近是指病痛的局部和邻近部位。全身按上下可分头面、颈项、胸、背、腰腹、小腹和骶、上臂、前臂及手、大腿、小腿及足部，各部的病痛即在其范围内配穴，均为近配法。本法多用于四肢体表疾患。如对肘痛取曲池、天井；膝痛取犊鼻、阳陵泉；腕痛取阳池、外关；足痛取解溪、昆仑等。头身部疾病也常选用本法。如眼病选睛明、风池；牙痛选颊车、下关；耳病选耳门、翳风；鼻疾取迎香、印堂；咳嗽取天突、肺俞；胃脘痛取中脘、梁门、胃俞；腹痛取天枢；膀胱病取中极、关元、次等。病痛的局部如有炎性病灶、创伤、疤痕或是重要的脏器时，一定要避开局部的穴，而改用邻近的穴位，称之近部配穴法。除了以经络学说为指导外，李氏还结合神经节段的理论来选配穴，临床时对内脏病证取有关夹脊穴等。根据神经的同节段和近节段就近取配穴，均属近部配穴法之列。
２．远道配穴法：远是病痛的远隔部，一般以肘膝以下的穴位为主。本法多用于内脏疾患。
如喘嗽、咯血取配尺泽穴；胸痛取内关穴；腹痛取足三里穴等。对五官头身疾患也常用本法。
如齿痛取合谷穴；项强取列缺穴；腰痛取委中穴等均是。这里讲的远是指远离病所。由于十二经脉本标相互联系，所以病在上取之下，病在下取之上。基于左右两侧经脉对称分布，并和任督脉交会联系，病在左取配之右，病在右取配之左。这种取穴距离病所较远，所以称之为远道配穴法。远道取穴法，历代针灸学家积累了丰富经验。如《肘后歌》说：“头面之疾针至阴，腿脚有疾风府寻；心胸有病少府泻，脐腹有病曲泉针。肩背诸疾中渚下，腰膝强痛交信凭；胁肋腿痛后溪妙，股膝肿起泻太冲。阴核发来如升大，百会妙穴真可骇；顶心头痛眼不开，涌泉下针足安泰……”。《灵枢·邪气脏腑病形篇》又指出：“荥输治外经（指阳经的荥穴和输穴），合治内府（指六腑的下合穴）。”《灵枢·寿夭刚柔篇》中的“病在阴（指体腔）之阴（指五脏）者，取阴（指阴经）之荥输”。这就更进一步地说明了远道取穴法虽以肘膝以下的穴位为代表，但也包括头身部穴位。凡是取远隔病所的相宜穴位，都可称之为远道配穴法的应用。除了按经络学说的远端配穴法之外，还可根据神经分布远端配穴。多数是指四肢部的病症，配用较高部位的神经干和神经根上的穴位。例如手指病症，就近可配正中神经上的内关和外关，桡神经上的曲池，远道可配臂丛上的一些穴位。小腿病症，就近可配腓神经上的阳陵泉，胫神经上的委中穴，远道可配坐骨神经的秩边穴及骶丛上的一些穴位。这种配穴法，又称之为高位配穴法。
３．随症配穴法：近部配穴和远道配穴是以配穴部位和病所距离为依据的，而有的疾病不限于局部，是全身性的，所以对这些病症的配穴，归属于随症配穴法。例如《难经》说的：“血会膈俞，气会膻中，脉会太渊，筋会阳陵泉，骨会大杼，髓会绝骨，脏会章门，腑会中脘”。这些穴位都和某一方面的病症有着密切的关系，临床可以随症配选穴位。另外，特定穴中都有一定的主治症，如五输穴：“井主心下满，荥主身热，输主身疼，经主喘咳、寒热，合主逆气而泄”。古代医籍的记载，可供研究临床配穴的参考。根据李氏数十载的临床经验，总结出某些穴位对全身病症具有比较显著的作用。如大椎退热、人中苏厥、三里降逆、关元温阳等。凡根据某些证候而配选的要穴，都属于随症配穴法。举例见右表。
常见症配穴举例表症　状配　　穴症　状配　　穴发热大椎　曲池　合谷昏迷人中　十宣　涌泉休克灸百会　脐中　关元；针足三里多汗合谷　复溜盗汗后溪失眠神门　三阴交　太溪多梦心俞　神门　太冲嘶哑扶突　合谷　间使嚼肌痉挛（牙关紧闭）
下关　颊车　合谷舌肌麻痹哑门　廉泉　合谷喉梗阻天突　扶突　合谷　内庭流涎人中　颊车　太冲　廉泉心悸内关　郄门心区痛膻中　内关咳嗽天突　列缺　鱼际咽下困难（噎症）
天突　内关　太冲　内庭胸闷中脘　内关恶心呕吐内关　足三里膈肌痉挛（呃逆）
膈俞　内关　劳宫腹胀天枢　足三里胁肋痛支沟　阳陵泉消化不良足三里　公孙尿潴留三阴交　阳陵泉；灸气海尿失禁曲骨　三阴交；灸关元遗精、阳痿、早泄关元　三阴交　秩边便秘天枢　支沟脱肛长强　承山；虚者灸百会，实者针秩边腓肠肌痉挛承山　阳陵泉皮肤瘙痒曲池　血海　三阴交虚弱关元　足三里（二）配穴方法配穴法是指临床时穴位如何配伍，并非指处方的一般原则，在应用时一定要根据病情的变化而随症加减配穴。现将李氏配穴方法和特点归纳如下：
１．前后配穴法：前是指胸腹，后是指背腰。前后呼应的配穴，在《灵枢·官针篇》十二刺中曾提出“偶刺”。李氏说：一般来讲正对病痛所在的胸腹（前）或背（后）部的穴位，凡和病情相适应的都可选配用。如胃病，前面配取中脘，后面就可与取胃俞。在特定穴中，五脏六腑于背部各有背俞，胸腹部各有募穴。由于脏腑的功能作用关系着全身，故俞、募的治疗影响很大，能够适用于多方面的疾病，是躯干的重要腧穴。对脏腑疾病来讲，配用俞募穴是近取法；对五官四肢病症来说，用俞募穴是随症配穴法。五腑俞，对于五官、五体都有一定的作用。如肝应目及筋，心应舌及脉，脾应口及肌肉，肺应鼻及皮肤，肾应耳及骨髓等。另外，募穴邻近穴，也有和募穴相似的作用。如中脘之旁的梁门，天枢之旁的大横，关元之旁的水道穴等均是。故用前后配穴可以俞募为代表，但不仅限于俞募。临床时前后可以同用，也可根据病情分别选用，或和其他配穴法使用。
２．表里配穴法：阳经与阴经表里相贯，表里配用有增强穴位的协同作用。如胃脘痛取配公孙和足三里，咳嗽取太渊和合谷等均是。除了一般的表里经穴配用外，还有原络配穴法。即何经的病症，取其本经的原穴为主，配用其表里经的络穴为辅，以原为主，络为客，称为主客原络配穴法。例如肺经病症取配肺经原穴太渊，配大肠经之络穴偏历；大肠经病取配大肠经原穴合谷，配肺经络穴列缺等。表里配穴还包括表经病症配里经穴，里经病症配取表经穴。在透穴针刺法中还可表里经相透，如内关透外关等。
３．上下配穴法：上是指上肢和腰部以上的穴，下是指下肢和腰部以下的穴。临床时上下肢配穴应用最广。例如肩部疾患可取上肢的中渚穴，下肢的阳陵泉穴。咽炎、牙痛，上肢取合谷，下肢配取内庭穴等。除了一般的上、下肢穴位配用外，还特别提出了八脉交会八穴。这是指上下肢四对穴位，能主治有关奇经八脉病症。而且说明八穴是和奇经八脉相通。八穴分属上、下肢，应用时上、下配合。内关通阴维，在上公孙通冲脉，在下两穴相配合，主治心、胸、胃方面的病症。外关通阳维，在上临泣通带脉，在下两穴相配合，主治目外眦、耳后、颊、颈、肩部病症。
后溪通督脉，在上申脉通阳跷，在下两穴相配，合主目内眦、颈项、耳、肩膊方面的病症。列缺通任脉，在上照海通阴跷，在下两穴相配，合主肺、咽喉、胸膈部病症。
４．左右配穴法：指经络穴位，左右两侧相对应。对于内脏病症的取配穴，一般以左右配伍加强其治疗作用。如胆道系统疾病，取两胆俞，或两阳陵泉等都是。此外，左右交叉取配穴是远道取穴法的一种。就是左侧病痛，取右侧相对应穴位。右侧病痛取左侧相对应的穴位。如踝关节急性扭伤，李氏在临床中多是采用这种配穴法。
５．远近配穴法：由于经络的本部和标部相呼应，在选穴原则中已提到近取配和远取配的概念。临床治疗，这两者常互相配合。如胆病取配胆俞穴等是近取配，取阳陵泉等穴是远取配，将远近参合起来就成远近配穴法。远近配穴法是各项配穴法的总的概括。除了上述的上下配穴外，另一种配法，则是将八穴分别选配用作头身脏腑病症远道取配法的主穴。如《针灸大成》记载的：“中满不快，胃脘受寒，选取内关为主，后取中脘、大陵、三里等穴。”指出选取主治之穴，次取随症各穴而应之。这种主穴配伍李氏认为都是属于远近配穴。现将临床常用之远近配穴例表于下：
各部疾病就近选配和远道选配穴举例表病　位　　　　就近选穴　　　　远道选穴头部前额印堂、阳白合谷、内庭颞部太阳、率谷中渚、足临泣后头风池、天柱后溪、束骨头顶百会太冲续表病　位　　就近选穴　　远道选穴眼部睛明、承泣、风池合谷鼻部印堂、迎香合谷口齿部颊车、下关、地仓合谷耳部翳风、听宫、听会中渚、外关舌部廉泉合谷咽喉部天突合谷气管天突列缺肺脏肺俞、膻中、天突列缺、尺泽心脏心俞、厥阴俞、膻中内关、神门、间使、郄门胃胃俞、中脘内关、足三里肝脏肝俞太冲胆胆俞胆囊穴、阳陵泉肠大肠俞、小肠俞、天枢、关元上巨虚、足三里肾脏肾俞、志室太溪膀胱次、中极三阴交生殖器中极、关元、子宫三阴交肛门长强、秩边承山上肢肩、曲池、合谷夹脊（颈５～胸１）、颈臂下肢环跳、委中、阳陵泉、悬钟夹脊（腰３～骶１）
（三）临床应用针灸疗法，临床上可以单独应用，又可与其他疗法配合，形成综合治疗。在针灸治疗中，各种针具和灸法又各有特点，应用时还须根据病情有所选择，或单用，或同用，或交互使用，使其发挥更好的临床疗效。针和灸都是外治法，是以激发机体的反应机能而发挥作用。刺激的质和量一定要适合机体的机能状态。换言之，在治疗中一定要使患者感觉舒适为度，以免影响患者的心理、生理而影响疗效。为此，临床应用中务必注意以下三个问题：
１．穴位之更换：因周身穴位各有特性，而同经同部的穴位又多有类似作用。针灸的配伍处方，一次选用穴位不宜过多。经过数次治疗之后，须根据病情，作适当的化裁加减。加减的原则是，如病情较复杂，要分缓急先后，急者先治，缓者后治，分次进行治疗。如病情较单纯，也不一定长时间用某穴某方，要用具有相似作用的穴位作适当加减，或分几个处方轮流使用。对新接受针灸治疗的患者，特别是有畏针者，初针时取穴宜少，以后可逐渐适当增加。
２．方法的运用：《灵枢·官针篇》讲：“九针之宜，各有所为，长短大小，各有所施。”《官能篇》又说：“针所不为，灸之所宜。”说明各种针法和灸法各有特点。近代在原有针灸疗法的基础上又发展成多种新疗法。但是一定要根据患者的情况，择其适合病家的方法而从之。
３．治疗时间：针灸治疗应有一定的间隔时间，少数急性症可一天数次，慢性病症可１～３日一次。而对须长期治疗的患者，一定要订立疗程方案，应间接性治疗。或停治一定时间，视其疗效变化情况再确定治疗方案和计划。临床也可于针灸施治期间或停治期内配用其他疗法，如气功、药物、推拿等。只要是对病家有效的方案、方法都可运用，以达到治愈疾病，解除患者病痛之目的。